发信人: zhangkx (木鱼子), 信区: Lixueyuan
标  题: 生物学数据库 Biology Databases
发信站: 哈工大紫丁香 (2003年06月02日10:14:20 星期一), 站内信件

生物学数据库 Biology Databases
http://bioinfor.cicams.ac.cn/webdata.htm


                               基因数据库

EMBL（EMBL nucleotide sequence database EMBL核苷酸序列数据库）
DDBJ（DNA Data Bank of Japan 日本DNA数据库）
GenBank（GenBank 基因序列数据库）
MIM（Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) 人类孟德尔遗传网上数据库）
GDB--The Genome Database
Lawrence Berkeley Human Genome Informatics
Oak Ridge Informatics Group 

MGD（Mouse genome database 小鼠基因组数据库） 

ZFIN（Zebrafish Information Network genome database 斑马鱼信息网基因组数据库） 

FlyBase（Drosophila genome database 果蝇基因组数据库） 

MaizeDB（Maize genome database 玉米基因组数据库）
MAIZE-2DPAGE（Maize genome 2D Electrophoresis database 玉米基因组双向电泳数据库
）
Mendel（Mendel-GFDb (Plant genes families database) 孟德尔植物基因家族数据库） 

Delection (酵母功能基因组)
SGD（Saccharomyces Genome Database 酵母基因组数据库）
DictyDb（Dictyostelium discoideum genome database Dictyosteliumdiscoideum基因组
数据库） 
 
大肠杆菌
ECO2DBASE（Escherichia coli gene-protein database (2D gelspots) 大肠杆菌基因-蛋
白数据库）
EcoCyc（Encyclopedia of E.coli genes and metabolism 大肠杆菌基因和代谢百科全书
）
EcoGene（Escherichia coli K12 genome database Escherichia coliK12基因组数据库）
 
枯草杆菌
NRSUB（Non-redundant B.subtilis database 无冗余枯草杆菌数据库）
SubtiList（Bacillus subtilis 168 genome database 枯草杆菌168基因组数据库）
TIGR（The bacterial database(s) of 'The Institute of GenomeResearch' 基因组研究
所的细菌数据库） 

分支结核杆菌
TubercuList（Mycobacterium tuberculosis H37Rv genomedatabase分支结核杆菌H37Rv基
因组数据库） 

HIV（HIV sequence database HIV序列数据库） 

PRESAGE（Collaborative resource for structural genomics 结构基因组学联合资源）
IMGT（ImMunoGeneTics db 免疫基因标记数据库）
KEGG (基因相互作用) 

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                                   蛋白数据库 

DOMO（Protein Domain database 蛋白质结构域数据库）
HSSP（Homology-derived secondary structure of proteins database 蛋白质同源二级
结构数据库）
PDB（Protein Data Bank 蛋白质结构数据库）
Pfam（Pfam protein domain database 蛋白质结构域数据库）
ProDom（ProDom Protein domain database 蛋白质结构域数据库）
PROSITE（PROSITE: protein domains and families database 蛋白质结构域和家族数据
库） 


PIR（Protein sequence database of the Protein Information Resource 蛋白质信息资
源数据库）
PRINTS（Protein Motif fingerprint database 蛋白质模式数据库）
 


ECO2DBASE（Escherichia coli gene-protein database (2D gel spots) 大肠杆菌基因-
蛋白数据库）
WormPep（Caenorhabditis elegans genome sequencing project proteindatabase线虫基
因组测序计划蛋白数据库）
YPD（Yeast protein database 酵母蛋白质数据库） 


CySPID (细胞骨架蛋白相互作用)
ENZYME（Enzymes nomenclature database 酶命名数据库）
GCRDb（G protein-coupled receptor database G蛋白耦联受体数据库）
REBASE（Restriction enzymes and methylases database 限制性酶和甲基化酶数据库）
TRANSFAC（Transcription factor database 转录因子数据库） BLOCKS（BLOCKS 蛋白质
模块数据库） http://www.blocks.fhcrc.org/ 
DOMO（Protein Domain database 蛋白质结构域数据库） 
 ENZYME（Enzymes nomenclature database 酶命名数据库） 
 GCRDb（G protein-coupled receptor database G蛋白耦联受体数据库） 
 GeneCards（GeneCards: human genes, protein and diseases 基因卡：人基因、蛋白和
疾病）  
PDB（Protein Data Bank 蛋白质结构数据库） 
HSSP（Homology-derived secondary structure of proteins database 蛋白质同源二级
结构数据库） 
 Pfam（Pfam protein domain database 蛋白质结构域数据库）  
PIR（Protein sequence database of the Protein Information Resource 蛋白质信息资
源数据库） 
PRINTS（Protein Motif fingerprint database 蛋白质模式数据库） 
 ProDom（ProDom Protein domain database 蛋白质结构域数据库） 
PROSITE（PROSITE: protein domains and families database 蛋白质结构域和家族数据
库） 
REBASE（Restriction enzymes and methylases database 限制性酶和甲基化酶数据库） 
WormPep（Caenorhabditis elegans genome sequencing project protein database线虫
基因组测序计划蛋白数据库） 
YPD（Yeast protein database 酵母蛋白质数据库） 

　
 


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                                    综合数据库

GeneCards（GeneCards: human genes, protein and diseases 基因卡：人基因、蛋白和
疾病） 

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如果想要飞得高 就该把地平线忘掉
闭上你的眼
不停地去感觉
不停地去创造...... 

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