Biology 版 (精华区)
发信人: zjliu (Robusting), 信区: Biology
标 题: PCR技术的基本原理
发信站: 哈工大紫丁香 (Mon Dec 23 16:18:56 2002) , 转信
PCR技术的基本原理
PCR技术的基本原理 类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补
的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩
增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,
引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,
靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留
复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种
新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟, 2~3小时就能将待扩目的基
因扩增放大几百万倍。(Plateau)。 到达平台期所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。
PCR的反应动力学 PCR的三个反应步骤反复进行,使DNA扩增量呈指数上升。反应最
终的DNA 扩增量可用Y=(1+X)n计算。Y代表DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次
的扩增效率,n代表循环次数。平均扩增效率的理论值为100%,但在实际反应中平均效率达
不到理论值。 反应初期,靶序列DNA片段的增加呈指数形式,随着PCR产物的逐渐积累,被
扩增的DNA 片段不再呈指数增加,而进入线性增长期或静止期, 即出现“停滞效应” ,
这种效应称平台期数、PCR 扩增效率及DNA聚合酶PCR的种类和活性及非特异性产物的竟争
等因素。大多数情况下,平台期的到来是不可避免的。
PCR扩增产物 可分为长产物片段和短产物片段两部分。短产物片段的长度严格地限
定在两个引物链5'端之间,是需要扩增的特定片段。短产物片段和长产物片段是由于引物
所结合的模板不一样而形成的,以一个原始模板为例,在第一个反应周期中, 以两条互补
的DNA为模板,引物是从3'端开始延伸, 其5'端是固定的,3' 端则没有固定的止点,长短
不一,这就是“长产物片段”。进入第二周期后,引物除与原始模板结合外,还要同新合
成的链(即“长产物片段”)结合。引物在与新链结时, 由于新链模板的5'端序列是固定的
, 这就等于这次延伸的片段3'端被固定了止点, 保证了新片段的起点和止点都限定于引
物扩增序列以内、形成长短一致的“短产物片段”。不难看出“短产物片段”是按指数倍
数增加, 而“长产物片段”则以算术倍数增加, 几乎可以忽略不计, 这使得PCR的反应
产物不需要再纯化,就能保证足够纯DNA片段供分析与检测用。
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