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发信人: lhqian (一心一意的革命者), 信区: Biology
标 题: 果蝇基因组测序完成
发信站: 紫 丁 香 (Sun Mar 19 18:55:20 2000) WWW-POST
果蝇基因组测序完成
《科学此刻》 2000年2月18日
在基因组的竞赛中,果蝇领先了一步。一个公共和私人的合作用一个两年前受到公开抨击
的方法,基本上完成了果蝇基因组的测序,这是迄今为止完成的最大的基因组。
位于美国马里兰州的Celera Genomics公司与几个科研中心的科学家合作,确定了构成果
蝇(Drosophila)基因组含有基因段落的1.2亿个碱基对的97%,已测出的百分比之高使许多
科学家认为可以说测序任务已经完成。Celera公司的Mark Adams说,剩下的3%在未来的几
个月内也将完成。果蝇基因组其余的6000万个碱基对包括了重复的和不编码的DNA,现有
的测序技术对它们用不上,而且科学家对其也兴趣不大。
一个世纪以来,遗传学家靠研究果蝇基因的突变来了解基因是如何工作的。近几年来,科
学家认识到许多果蝇的基因在其它生物体包括人类有相互的对应,使得果蝇成为更为有益
的研究工具。美国加州大学圣迭戈分校的遗传学家Lawrence Goldstein说,掌握了果蝇的
基因组将“改变我们做研究的方式。”
Celera的成功也许能改变一些对该公司的整个基因组“鸟枪方法”(whole genome
shotgun approach)持怀疑态度的人的看法,该方法将DNA打成无数的碎片分别测序,然后
用高性能的计算机把序列重新组合起来。1998年5月,当Celera总裁J. Craig Venter宣布
他打算用此方法来测序人类的基因组时,他的竞争对手们对此持极大的怀疑态度。许多人
预测Venter不可能将成百万的片段正确地组合起来,完成的序列里将会有许多空缺。但部
分由于Celera公司的生物信息学家Gene Myers开发的一个计算机程序,这个方法的“效果
比任何人想象得都好”,加州大学伯克力分校的遗传学家Gerald Rubin说。
测出的果蝇序列中现还有1600个空缺,但用寻找基因的计算机程序和其它的分析手段,人
们发现果蝇的基因大概有13000之多。Adams说,研究人员对其中一半的功能一无所知。但
他说,有些关键的基因“显而易见”,比如人们寻找已久的肿瘤抑制基因p53在果蝇的对
应基因。Goldstein说,有了所有基因的序列将使研究工作“如箭上弦。”
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玉炉冰簟鸳鸯锦,粉融香汗流山枕。
外辘轳声,
敛眉含笑惊。
柳阴烟漠漠,低鬓蝉钗落。
须作一生拼,尽君今日欢。
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