Biology 版 (精华区)

发信人: Ingrid (新世纪的灵儿), 信区: Biology
标  题: 基因的新功能及新基因的发现(8)
发信站: 紫 丁 香 (Mon Jan  3 21:13:20 2000), 转信



发信人: zel (雨), 信区: biology
标  题: 基因的新功能及新基因的发现(8)
发信站: 饮水思源站 (Wed Dec 29 22:54:15 1999), 转信

2、工作基础
(1)研究基础
参与本领域Part B部分工作的同志们,在原来和进行中的研
究课题中,均已有了国际水平的研究成果和长期的研究积累
(见七项中附表)。
A.寻找结瘤调控新因子
a.我们选取R. leguminosarum bv. viciae的结瘤基因作为研
究对象。在这种根瘤菌里nodD只有一个拷贝,却具有激活和
自身负反馈两种能力,对它的研究有助于我们同时了解正、
负两方面的调控。洪国藩组自1987年在国际上率先证明NodD
是DNA结合蛋白(Hong et al, 1987)以来,在结瘤基因调控方
面又作了许多工作,取得了进展。
b.在对NodD的研究中,NodD的大量纯化尚是国际性难题,在
E.coli中高效表达的NodD或者没有激活功能或者连DNA结合
能力也丧失殆尽。我们已用DNA亲和层析法自根瘤菌部分纯
化了NodD,满足了随后实验对纯度的要求。也构建了高效
表达NodD的E. coli工程菌,期望能改进条件得到有较高活
性的NodD。
发现NodD与DNA的结合在较高浓度的类黄酮存在下被解离。
使用足迹法确定了NodD在nodA-D基因间区和nodF启动子区的
结合顺序。它们都可以分为两部分,与R.meliloti 的情况
相比有保守性。
NodD的结合在nodA-D基因间区和nodF启动子区造成轻微的弯
折(20° 左右),R. meliloti中的弯折角度要大些(至少36° )。
c.顺式元件的研究 羟胺随机突变结合报道基因转录活性分析
发现影响nodD基因表达的核苷酸集中在上游两个旋转对称区,
据此提出了NodD自身负反馈的环出模型(Mao et al.1994)。
自nodA方向和nodD方向各产生了一套系统缺失,证明NodD的自
身负反馈需要与nod box 的结合,并在nodA-D间区分出若干功
能亚区,部分结果还提示存在新的调控因子。
d. RNA聚合酶的研究 纯化了根瘤菌的RNA聚合酶,建立了体外
转录系统。含nodA-D基因间区的DNA片段在体外转录中可以得到
nodD方向的特异产物,此产物的量受NodD的抑制。
分析了RNA 聚合酶在nodA-D间区的结合顺序;发现这种富含s
70同源亚基的制剂在nodF启动子区没有显著的保护。
e. 寻找调控结瘤基因表达的新因子 1987年我们即观察到根瘤
菌中存在另外的与nodA-D基因间片段和nodF启动子结合的蛋白,
最近对此成分(称作Px)作了进一步研究。发现它可以与NodD分离
开。部分纯化的蛋白保持DNA结合活性,并且在nodA-D基因间片
段和nodF启动子上能造成强烈弯折(77° 和44° )。它在nodA-D
间区有一个保护位点,在nodF启动子区有两个保护位点,其保护
区与NodD和RNA聚合酶的保护区有明显差异,而且自身之间缺乏
保守性。
Western分析发现R.leguminosarum中GroEL能和NodD共纯化,但二
者并非总联系在一起。
f.技术改进 提出了“足迹测序”的方法,凝胶内蛋白-DNA结合的
方法,改进“G+A”化学测序方法,发展了一种基于生物素-亲和素
系统确定DNA结合蛋白种类和分子量的方法。
B.抗棉花黄萎病基因等
a. 已从抗黄萎病棉花中分离到抗黄萎病菌的功能蛋白质。
b. 已从大穗小麦中通过RAPD技术,获得一特异DNA片段,并在多株
不同的大穗(密穗)小麦中验证该DNA片段有存在,已进行了测序分析。
c. 已得到慈菇蛋白酶抑制剂基因5'-上游约300bp的顺序。
d. 在花粉管道操纵技术转基因研究方面有良好的基础。

(2) 设备条件
已基本具备了展开研究所需的实验材料,掌握了研究技术,具备了
研究体系。
已基本具备了展开研究所需的仪器、设备,如高速冷冻离心机,台
式冷冻离心机,层析系统,各种电泳系统,微生物培养摇床,PCR
仪、杂交炉等,但有些常规仪器已老化,需更新。
另需要时可借用本所及分子生物学国家重点实验室的公用或大型
仪器,如超速冷冻离心机,高压液相色普仪,分光光度计等。

(3) 经费来源
"八五”期间获“863”计划和“攀登”计划相关项目的支持;
“九五”期间主要依靠“攀登”计划项目的支持; 1995-1997年
国家重点科技攻关项目;1995-1997年中国科学院重点项目;19
95-1997年上海市农委科技攻关项目; 1995-1998年上海市自然科
学基金项目。现有科研经费100余万元。

3、科研队伍结构与人才培养
本部分现有研究员2人,副研究员1人,高级实验师3人,助理研究
员2人, 博士后1人,其他科技人员7人。
随着今后老专家的退休及年青科研人员的出国深造,需要不断调整
补充,重视对科研人才的培养,尽可能的培养硕士和博士研究生,
毕业后争取他们留组内工作。培养初级研究人员尽培养快晋升为中
级人员。让中级研究人员在组内担负研究重任,尽快成为高级研究
人才。使他们成为跨世纪学科带头人,达到本课题组新老研究人员
更替,使科研工作后继有人。争取形成一支主要研究骨干相对稳定
、由老中青科技人员组成的科研队伍。同时,要与在国外的科研人
员( 特别是博士后等 )保持联系,争取他们以多种方式为所或回所
工作,加强我们的研究力量。

4、学术交流与国际合作
与英国John Innes 研究所自1987年起就保持着良好的合作关系,
双方在研究材料、人员等方面都有实质性交流合作,并已在国内外
学术期刊上联合发表了多篇研究论文,主要有Hong等, NAR, 1987;
Mao等Gene, 1994等。在1996年澳大利亚固氮会议期间,洪国藩教授
与A. Downie教授充分肯定了前阶段双方的合作成果,对进一步广泛
合作达成了共识,双方计划加强结瘤基因调控机理的合作研究。该
组与法国 Toulouse 的CNRS-INRA 的植物与微生物相互关系的分子
遗传学研究实验室也建有密切合作关系,双方学术带头人曾多次互
访,1993年生化所倪福弟在法国该实验室高效表达、纯化了固氮调
控蛋白FixK,并进行了功能研究,结果导致一个新的固氮基因调控
蛋白( FixT)的发现( Foussard等,Mol. Microbiology, 1997)。结
合在结瘤基因方面的新发现,双方决定在共生固氮调控新基因的寻
找方面加强合作。
在国内与江苏省农科院和上海市农科院已有多年的合作,在棉花、
蔬菜的抗病、虫害分子育种中取得一定的成果,并重视所内研究组
之间的合作研究(与刘望夷组合作研究樟树种子RIP基因)。与台湾省
中央研究院植物研究所正进行讨论研究分子育种计划,准备合作三
年。争取与澳大利亚Cooperative Research Centre of Plant Scie
nce 合作研究改变基因表达控制植物生长发育。
重视国内外新科技发展动态,每月组织学术报告和科研工作汇报
交流,对新的研究动向或趋势,积极鼓励整理综述或翻译发表文
章。在经费许可情况下,积极让组内研究人员争取参加国内和国
际的学术讨论会。

5、承担任务情况(1991~ 1997年)
承担的研究项目包括国家自然科学基金项目、八六三计划项目、
中国科学院重大与重点项目、国家攀登计划项目等研究课题(详
见统计表)。
6、附表
表1. 1990~ 1996年本领域论文发表统计
领 域
 国际刊物
 国内刊物
 国际学术会议
 全国学术会议
 专 著

基因的新功能及新基因的发现
 44
 119
 7
 25
 4


表2. 1990-1996年本领域成果统计
重大成果
 上海市
 部委及其
 成 果
 获直接

国家级
 中科院
   它省市
 转 让
 经济效益

3
 1
 2
 2
 2
 2

表3. 1990年~ 1996年本领域获奖成果情况
成果名称
 成果登记号
 主要完成人
 获奖类别及等级

乙型肝炎病毒基因的克隆与表达
   李载平
 90年获国家自然科学二等奖

高温DNA顺序测定系统的创立
 153831911171
 洪国藩
 93年获国家科技进步二等奖

人表皮生长因子基因工程实验室研究
 153831931201
 李载平
 95年获上海市科技进步二等奖

NF-IL6mRNA的3’非翻译区的肿瘤抑制功能
 153831951001
 刘定干

家蚕个体表达系统
 153831951006
 吴祥甫

表4. 1991年~ 1997年7月本领域承担课题情况

序号
 项 目 名 称
 课题来源
 经费
 起止时间
 负责人

1
 乙型肝炎病毒变异株研究
 国家基金委
 6
 9301-9512
 甘人宝

2
 人乙型肝炎病毒基因产物和真核细胞蛋白因子
 国家基金委
 6
 9301-9512
 俞贤明
 相互作用





3
 外源DNA(基因)通过苗端基于分生组织细胞转
 国家基金委
 6
 9401-9612
 周光宇

 化植株理论





4
 调控蓖麻蚕rRNA基因复制与转录的染色板模板
 国家基金委
 9
 9601-9812
 赵慕钧

5
 利用细胞遗传工程培育抗病水稻的研究(合作)
 国家基金委
 0.8

 龚蓁蓁

6
 人表皮生长因子中试研究
 国家科委
 30
 9101-9412
 李载平

7
 共生固氮体系中最佳结瘤固氮控制模型的研
 国家科委
 178.8
 9101-9512
 洪国藩

 究(攀登主持)





8
 人抗癌基因研究
 国家科委
 50
 9101-9512
 刘定干

9
 根瘤菌和植物寄主相互关系的分子遗传研究
 国家科委
 40
 9101-9512
 倪福弟

10
 阻断乙肝病毒复制的新技术(合作)
 国家科委
 12.56
 9101-9512
 吴祥甫

11
 家蚕个体表达系统(合作)
 国家科委
 48
 9101-9612
 吴祥甫

12
 红细胞生成素基因工程(合作)
 国家科委
 26.5
 9201-9512
 吴祥甫

13
 羊个体表达系统(合作)
 国家科委
 8
 9201-9612
 吴祥甫

14
 抗虫棉及其杂种优势利用(合作)
 国家科委
 3
 9506-9706
 龚蓁蓁

15
 重组降钙素的研究
 国家科委
 50
 9601-2000
 陈珍珍

16
 重组人表皮生长因子
 国家科委
 200
 9601-2000
 甘人宝

17
 家畜抗日本血吸虫(中国大陆株)多价抗原基
 国家科委
 30
 9601-2000
 吴祥甫

 因工程疫苗





18
 多价外源基因及偶联表达得重组昆虫病毒表
 国家科委
 100
 9601-2000
 杨冠珍

 达系统





19
 抗癌基因表达元件
 国家科委
 65
 9601-200012
 刘定干

20
 转API基因抗虫棉的分子研究(合作)
 国家科委
 3
 9601-9812
 龚蓁蓁

21
 花卉分子育种
 上海市农委
 10
 9701-9912
 周光宇

22
 抗虫基因在夏淡菜中的导入及转基因植株
 市农科院
 4.5
 9506-9805
 龚蓁蓁

 的再生





23
 乙肝病毒(HNV)3.5kbRNAs转录调控机理
 市择优
 2
 9412-9512
 赵新泰

 的研究





24
 新的癌基因和抗癌基因及其相关调控基因
 市自然基金
 10
 9510-9710
 刘定干

25
 留学择优
 院教育局
 1
 9201-9312
 陶全洲

26
 AP2烟草研究(合作)
 云南农科院
 0.5
 9501-9512
 龚蓁蓁

27
 真核基因表达调控机制研究(合作)
 中科院
 10
 9401-9612
 吴 雪 雪

28
 鲑鱼降钙素基因工程研究
 中科院
 6
 9701-9912
 李载平

29
 慈菇蛋白酶抑制剂基因及中间载体
 中科院重大
 12
 9101-9512
 龚蓁蓁

30
 主要农作物新品种选育技术
 中科院重大
 14.5
 9101-9512
 周光宇

(续上表)
31
 GM-CSF
 中科院重大
 50
 9701-2000
 甘人宝

32
 鲑鱼降钙素
 中科院重大
 25
 9701-2000
 甘人宝

33
 ES细胞和老年性痴呆基因
 中科院重大
 20
 9701-2000
 李载平

34
 EGF
 中科院重大
 15
 9701-2000
 李载平

35
 植物分子育种小麦优良品系
 中科院重点
 7
 9501-9612
 龚蓁蓁

36
 植物分子育种小麦优良品系有用基因的
 中科院重点
 3
 9501-9712
 龚蓁蓁

 定位(合作)





项目总经费(万元)
 1053.16




表5. 1997年7月本领域在研课题情况表

序号
 项 目 名 称
 课题来源
 经费
 起止时间
 负责人

1
 调控蓖麻蚕rRNA基因复制与转录的染
 国家基金委
 9
 9601-9812
 赵慕钧

 色板模板





2
 重组降钙素的研究
 国家科委
 50
 9601-2000
 陈珍珍

3
 重组人表皮生长因子
 国家科委
 200
 9601-2000
 甘人宝

4
 家畜抗日本血吸虫(中国大陆株)多基
 国家科委
 30
 9601-2000
 吴祥甫

 价抗原因工程疫苗





5
 多价外源基因及偶联表达得重组昆表
 国家科委
 100
 9601-2000
 杨冠珍

 虫病毒达系统





6
 抗癌基因表达元件
 国家科委
 65
 9601-2000
 刘定干

7
 转API基因抗虫棉的分子研究(合作)
 国家科委
 3
 9601-9812
 龚蓁蓁

8
 花卉分子育种
 上海市农委
 10
 9701-9912
 周光宇

9
 抗虫基因在夏淡菜中的导入及转基
 市农科院
 4.5
 9506-9805
 龚蓁蓁

 因植株的再生





10
 新的癌基因和抗癌基因及其相关调
 市自然基金
 10
 9510-9710
 刘定干

 控基因





11
 鲑鱼降钙素基因工程研究
 中科院重大
 6
 9701-9912
 李载平

12
 GM-CSF
 中科院重大
 50
 9701-2000
 甘人宝

13
 鲑鱼降钙素
 中科院重大
 25
 9701-2000
 甘人宝

14
 ES细胞和老年性痴呆基因
 中科院重大
 20
 9701-2000
 李载平

15
 EGF
 中科院重大
 15
 9701-2000
 李载平

16
 植物分子育种小麦优良品系有用
 中科院重点
 3
 9501-9712
 龚蓁蓁

 基因的定位(合作)





项目总经费(万元)
 600.50



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