Biology 版 (精华区)
发信人: Ingrid (新世纪的灵儿), 信区: Biology
标 题: 基因的新功能及新基因的发现(8)
发信站: 紫 丁 香 (Mon Jan 3 21:13:20 2000), 转信
发信人: zel (雨), 信区: biology
标 题: 基因的新功能及新基因的发现(8)
发信站: 饮水思源站 (Wed Dec 29 22:54:15 1999), 转信
2、工作基础
(1)研究基础
参与本领域Part B部分工作的同志们,在原来和进行中的研
究课题中,均已有了国际水平的研究成果和长期的研究积累
(见七项中附表)。
A.寻找结瘤调控新因子
a.我们选取R. leguminosarum bv. viciae的结瘤基因作为研
究对象。在这种根瘤菌里nodD只有一个拷贝,却具有激活和
自身负反馈两种能力,对它的研究有助于我们同时了解正、
负两方面的调控。洪国藩组自1987年在国际上率先证明NodD
是DNA结合蛋白(Hong et al, 1987)以来,在结瘤基因调控方
面又作了许多工作,取得了进展。
b.在对NodD的研究中,NodD的大量纯化尚是国际性难题,在
E.coli中高效表达的NodD或者没有激活功能或者连DNA结合
能力也丧失殆尽。我们已用DNA亲和层析法自根瘤菌部分纯
化了NodD,满足了随后实验对纯度的要求。也构建了高效
表达NodD的E. coli工程菌,期望能改进条件得到有较高活
性的NodD。
发现NodD与DNA的结合在较高浓度的类黄酮存在下被解离。
使用足迹法确定了NodD在nodA-D基因间区和nodF启动子区的
结合顺序。它们都可以分为两部分,与R.meliloti 的情况
相比有保守性。
NodD的结合在nodA-D基因间区和nodF启动子区造成轻微的弯
折(20° 左右),R. meliloti中的弯折角度要大些(至少36° )。
c.顺式元件的研究 羟胺随机突变结合报道基因转录活性分析
发现影响nodD基因表达的核苷酸集中在上游两个旋转对称区,
据此提出了NodD自身负反馈的环出模型(Mao et al.1994)。
自nodA方向和nodD方向各产生了一套系统缺失,证明NodD的自
身负反馈需要与nod box 的结合,并在nodA-D间区分出若干功
能亚区,部分结果还提示存在新的调控因子。
d. RNA聚合酶的研究 纯化了根瘤菌的RNA聚合酶,建立了体外
转录系统。含nodA-D基因间区的DNA片段在体外转录中可以得到
nodD方向的特异产物,此产物的量受NodD的抑制。
分析了RNA 聚合酶在nodA-D间区的结合顺序;发现这种富含s
70同源亚基的制剂在nodF启动子区没有显著的保护。
e. 寻找调控结瘤基因表达的新因子 1987年我们即观察到根瘤
菌中存在另外的与nodA-D基因间片段和nodF启动子结合的蛋白,
最近对此成分(称作Px)作了进一步研究。发现它可以与NodD分离
开。部分纯化的蛋白保持DNA结合活性,并且在nodA-D基因间片
段和nodF启动子上能造成强烈弯折(77° 和44° )。它在nodA-D
间区有一个保护位点,在nodF启动子区有两个保护位点,其保护
区与NodD和RNA聚合酶的保护区有明显差异,而且自身之间缺乏
保守性。
Western分析发现R.leguminosarum中GroEL能和NodD共纯化,但二
者并非总联系在一起。
f.技术改进 提出了“足迹测序”的方法,凝胶内蛋白-DNA结合的
方法,改进“G+A”化学测序方法,发展了一种基于生物素-亲和素
系统确定DNA结合蛋白种类和分子量的方法。
B.抗棉花黄萎病基因等
a. 已从抗黄萎病棉花中分离到抗黄萎病菌的功能蛋白质。
b. 已从大穗小麦中通过RAPD技术,获得一特异DNA片段,并在多株
不同的大穗(密穗)小麦中验证该DNA片段有存在,已进行了测序分析。
c. 已得到慈菇蛋白酶抑制剂基因5'-上游约300bp的顺序。
d. 在花粉管道操纵技术转基因研究方面有良好的基础。
(2) 设备条件
已基本具备了展开研究所需的实验材料,掌握了研究技术,具备了
研究体系。
已基本具备了展开研究所需的仪器、设备,如高速冷冻离心机,台
式冷冻离心机,层析系统,各种电泳系统,微生物培养摇床,PCR
仪、杂交炉等,但有些常规仪器已老化,需更新。
另需要时可借用本所及分子生物学国家重点实验室的公用或大型
仪器,如超速冷冻离心机,高压液相色普仪,分光光度计等。
(3) 经费来源
"八五”期间获“863”计划和“攀登”计划相关项目的支持;
“九五”期间主要依靠“攀登”计划项目的支持; 1995-1997年
国家重点科技攻关项目;1995-1997年中国科学院重点项目;19
95-1997年上海市农委科技攻关项目; 1995-1998年上海市自然科
学基金项目。现有科研经费100余万元。
3、科研队伍结构与人才培养
本部分现有研究员2人,副研究员1人,高级实验师3人,助理研究
员2人, 博士后1人,其他科技人员7人。
随着今后老专家的退休及年青科研人员的出国深造,需要不断调整
补充,重视对科研人才的培养,尽可能的培养硕士和博士研究生,
毕业后争取他们留组内工作。培养初级研究人员尽培养快晋升为中
级人员。让中级研究人员在组内担负研究重任,尽快成为高级研究
人才。使他们成为跨世纪学科带头人,达到本课题组新老研究人员
更替,使科研工作后继有人。争取形成一支主要研究骨干相对稳定
、由老中青科技人员组成的科研队伍。同时,要与在国外的科研人
员( 特别是博士后等 )保持联系,争取他们以多种方式为所或回所
工作,加强我们的研究力量。
4、学术交流与国际合作
与英国John Innes 研究所自1987年起就保持着良好的合作关系,
双方在研究材料、人员等方面都有实质性交流合作,并已在国内外
学术期刊上联合发表了多篇研究论文,主要有Hong等, NAR, 1987;
Mao等Gene, 1994等。在1996年澳大利亚固氮会议期间,洪国藩教授
与A. Downie教授充分肯定了前阶段双方的合作成果,对进一步广泛
合作达成了共识,双方计划加强结瘤基因调控机理的合作研究。该
组与法国 Toulouse 的CNRS-INRA 的植物与微生物相互关系的分子
遗传学研究实验室也建有密切合作关系,双方学术带头人曾多次互
访,1993年生化所倪福弟在法国该实验室高效表达、纯化了固氮调
控蛋白FixK,并进行了功能研究,结果导致一个新的固氮基因调控
蛋白( FixT)的发现( Foussard等,Mol. Microbiology, 1997)。结
合在结瘤基因方面的新发现,双方决定在共生固氮调控新基因的寻
找方面加强合作。
在国内与江苏省农科院和上海市农科院已有多年的合作,在棉花、
蔬菜的抗病、虫害分子育种中取得一定的成果,并重视所内研究组
之间的合作研究(与刘望夷组合作研究樟树种子RIP基因)。与台湾省
中央研究院植物研究所正进行讨论研究分子育种计划,准备合作三
年。争取与澳大利亚Cooperative Research Centre of Plant Scie
nce 合作研究改变基因表达控制植物生长发育。
重视国内外新科技发展动态,每月组织学术报告和科研工作汇报
交流,对新的研究动向或趋势,积极鼓励整理综述或翻译发表文
章。在经费许可情况下,积极让组内研究人员争取参加国内和国
际的学术讨论会。
5、承担任务情况(1991~ 1997年)
承担的研究项目包括国家自然科学基金项目、八六三计划项目、
中国科学院重大与重点项目、国家攀登计划项目等研究课题(详
见统计表)。
6、附表
表1. 1990~ 1996年本领域论文发表统计
领 域
国际刊物
国内刊物
国际学术会议
全国学术会议
专 著
基因的新功能及新基因的发现
44
119
7
25
4
表2. 1990-1996年本领域成果统计
重大成果
上海市
部委及其
成 果
获直接
国家级
中科院
它省市
转 让
经济效益
3
1
2
2
2
2
表3. 1990年~ 1996年本领域获奖成果情况
成果名称
成果登记号
主要完成人
获奖类别及等级
乙型肝炎病毒基因的克隆与表达
李载平
90年获国家自然科学二等奖
高温DNA顺序测定系统的创立
153831911171
洪国藩
93年获国家科技进步二等奖
人表皮生长因子基因工程实验室研究
153831931201
李载平
95年获上海市科技进步二等奖
NF-IL6mRNA的3’非翻译区的肿瘤抑制功能
153831951001
刘定干
家蚕个体表达系统
153831951006
吴祥甫
表4. 1991年~ 1997年7月本领域承担课题情况
序号
项 目 名 称
课题来源
经费
起止时间
负责人
1
乙型肝炎病毒变异株研究
国家基金委
6
9301-9512
甘人宝
2
人乙型肝炎病毒基因产物和真核细胞蛋白因子
国家基金委
6
9301-9512
俞贤明
相互作用
3
外源DNA(基因)通过苗端基于分生组织细胞转
国家基金委
6
9401-9612
周光宇
化植株理论
4
调控蓖麻蚕rRNA基因复制与转录的染色板模板
国家基金委
9
9601-9812
赵慕钧
5
利用细胞遗传工程培育抗病水稻的研究(合作)
国家基金委
0.8
龚蓁蓁
6
人表皮生长因子中试研究
国家科委
30
9101-9412
李载平
7
共生固氮体系中最佳结瘤固氮控制模型的研
国家科委
178.8
9101-9512
洪国藩
究(攀登主持)
8
人抗癌基因研究
国家科委
50
9101-9512
刘定干
9
根瘤菌和植物寄主相互关系的分子遗传研究
国家科委
40
9101-9512
倪福弟
10
阻断乙肝病毒复制的新技术(合作)
国家科委
12.56
9101-9512
吴祥甫
11
家蚕个体表达系统(合作)
国家科委
48
9101-9612
吴祥甫
12
红细胞生成素基因工程(合作)
国家科委
26.5
9201-9512
吴祥甫
13
羊个体表达系统(合作)
国家科委
8
9201-9612
吴祥甫
14
抗虫棉及其杂种优势利用(合作)
国家科委
3
9506-9706
龚蓁蓁
15
重组降钙素的研究
国家科委
50
9601-2000
陈珍珍
16
重组人表皮生长因子
国家科委
200
9601-2000
甘人宝
17
家畜抗日本血吸虫(中国大陆株)多价抗原基
国家科委
30
9601-2000
吴祥甫
因工程疫苗
18
多价外源基因及偶联表达得重组昆虫病毒表
国家科委
100
9601-2000
杨冠珍
达系统
19
抗癌基因表达元件
国家科委
65
9601-200012
刘定干
20
转API基因抗虫棉的分子研究(合作)
国家科委
3
9601-9812
龚蓁蓁
21
花卉分子育种
上海市农委
10
9701-9912
周光宇
22
抗虫基因在夏淡菜中的导入及转基因植株
市农科院
4.5
9506-9805
龚蓁蓁
的再生
23
乙肝病毒(HNV)3.5kbRNAs转录调控机理
市择优
2
9412-9512
赵新泰
的研究
24
新的癌基因和抗癌基因及其相关调控基因
市自然基金
10
9510-9710
刘定干
25
留学择优
院教育局
1
9201-9312
陶全洲
26
AP2烟草研究(合作)
云南农科院
0.5
9501-9512
龚蓁蓁
27
真核基因表达调控机制研究(合作)
中科院
10
9401-9612
吴 雪 雪
28
鲑鱼降钙素基因工程研究
中科院
6
9701-9912
李载平
29
慈菇蛋白酶抑制剂基因及中间载体
中科院重大
12
9101-9512
龚蓁蓁
30
主要农作物新品种选育技术
中科院重大
14.5
9101-9512
周光宇
(续上表)
31
GM-CSF
中科院重大
50
9701-2000
甘人宝
32
鲑鱼降钙素
中科院重大
25
9701-2000
甘人宝
33
ES细胞和老年性痴呆基因
中科院重大
20
9701-2000
李载平
34
EGF
中科院重大
15
9701-2000
李载平
35
植物分子育种小麦优良品系
中科院重点
7
9501-9612
龚蓁蓁
36
植物分子育种小麦优良品系有用基因的
中科院重点
3
9501-9712
龚蓁蓁
定位(合作)
项目总经费(万元)
1053.16
表5. 1997年7月本领域在研课题情况表
序号
项 目 名 称
课题来源
经费
起止时间
负责人
1
调控蓖麻蚕rRNA基因复制与转录的染
国家基金委
9
9601-9812
赵慕钧
色板模板
2
重组降钙素的研究
国家科委
50
9601-2000
陈珍珍
3
重组人表皮生长因子
国家科委
200
9601-2000
甘人宝
4
家畜抗日本血吸虫(中国大陆株)多基
国家科委
30
9601-2000
吴祥甫
价抗原因工程疫苗
5
多价外源基因及偶联表达得重组昆表
国家科委
100
9601-2000
杨冠珍
虫病毒达系统
6
抗癌基因表达元件
国家科委
65
9601-2000
刘定干
7
转API基因抗虫棉的分子研究(合作)
国家科委
3
9601-9812
龚蓁蓁
8
花卉分子育种
上海市农委
10
9701-9912
周光宇
9
抗虫基因在夏淡菜中的导入及转基
市农科院
4.5
9506-9805
龚蓁蓁
因植株的再生
10
新的癌基因和抗癌基因及其相关调
市自然基金
10
9510-9710
刘定干
控基因
11
鲑鱼降钙素基因工程研究
中科院重大
6
9701-9912
李载平
12
GM-CSF
中科院重大
50
9701-2000
甘人宝
13
鲑鱼降钙素
中科院重大
25
9701-2000
甘人宝
14
ES细胞和老年性痴呆基因
中科院重大
20
9701-2000
李载平
15
EGF
中科院重大
15
9701-2000
李载平
16
植物分子育种小麦优良品系有用
中科院重点
3
9501-9712
龚蓁蓁
基因的定位(合作)
项目总经费(万元)
600.50
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