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发信人: loafer (快乐的化身), 信区: Chemistry
标  题: 免费量化软件（七）[转]
发信站: 哈工大紫丁香 (Mon Jun 30 21:35:03 2003)

发信人: neweroica (新英雄), 信区: Chemistry
标  题: 免费量化软件（七）
发信站: 北大未名站 (2003年01月05日14:42:59 星期天) , 站内信件

免费量化软件（七）
注：
1. 未经说明，一律用于各类Unix平台，包括装有Linux的PC机上。
2. 以能够对分子结构进行从头计算和半经验计算的软件为主。
3. 显示分子模型的软件没有包括在内，除非与列出的软件有密切关系。
4. 中文说明仅做参考。有些术语翻译得不一定准确，请参看相应主页上的原文。

按字母顺序排列：A-C D-F G-L M-N O-Z 其它

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其它
http://www.cineca.it/~acv0/CP/carpar.html
Car Parrinello代码。直接下载。

http://www.rzg.mpg.de/~abs/cp2k/index.html
CP2K。进行固态、液态，分子和生物体系中的原子、分子模拟。方法涉及从密度泛函到参
数
化的经典成对和多体势能。直接下载。

http://www.mpi-stuttgart.mpg.de/andersen/LMTODOC/LMTODOC.html
STUTTGART TB-LMTO-ASA程序。获得方法：发E-mail给andersen@and.mpi-stuttgart.mpg.
de
。

http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt26/casino.html
量子Monte Carlo程序CASINO。
量子Monte Carlo方法是处理中等尺寸分子最准确的从头计算方法，也可以处理分子和晶体
的
激发态。获得量子Monte Carlo程序CASINO，请与作者联系。

http://www.scripps.edu/~nwhite/Biomer/index.html
B程序。
在线java程序，用于建立多核苷酸(DNA/RNA)，多聚糖和蛋白质模型，交互式分子编辑器，
A
MBER力场几何优化，模拟分子动力学退火，并可以保存为gif，jpeg和ppm图像文件。

http://rugmd0.chem.rug.nl/~gmx/features.html
GROMACS。
蛋白质的完全自动拓扑生成器，大量的分析工具：分子动力学，leap-frog积分，定位lan
ge
vin动力学，简正模式分析，静电，非平衡分子动力学，NOE数据的NMR求精法。

http://comp.chem.umn.edu/omnisol/
OMNISOL
计算包含水和由H, C, N, O, F, S, Cl, Br, I构成的有机分子溶液的自由能。

http://www.pt.tu-clausthal.de/~ptpb
Projector Augmented Wave (PAW)方法。

http://lacebark.ntu.edu.au/j_mitroy/research/atomichf/atomichf.htm
一个计算原子结构的Hartree-Fock程序。

http://www.vuse.vanderbilt.edu/~cff/mchf_collection/
一些对原子结构进行量子化学计算的程序（MCHF & Hartree-Fock）。

http://www.cobalt.chem.ucalgary.ca/ps/symmetry/
Symmetry，一个简单的C++程序，用于分析一组分子坐标的点群对称性。
平台：MS-DOS，Compaq Tru64，SGI IRIX（理论上其它Unix环境不会遇到太大的编译问题
）
。

http://brian.ch.cam.ac.uk/software.html
一些用于研究原子、分子团簇的程序。

http://www.krl.caltech.edu/~aib/papdat.html
bkmp2，研究H3分子势能曲面的程序。

http://www.dl.ac.uk/TCSC/QuantumChem/quasi_www/manual_2.04/manual.html
http://www.dl.ac.uk/TCSC/QuantumChem/quasi_www/manual/manual.html
ChemShell。Unix/Linux下的图形用户输入界面，支持很多常见的量化程序。

http://www.hep.ph.rhbnc.ac.uk/~blair/detsim/brahms.html
BRAHMS，从头Monte Carlo计算的代码。

http://www.cmmp.ucl.ac.uk/~conquest/
CONQUEST是O(N)密度泛函代码，用于对大量原子进行准确的从头计算。使用Cray T3E的51
2个
节点，可以计算16,384个原子。

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哀公问曰：“何为则民服？”
孔子对曰：“举直错诸枉，则民服；举枉错诸直，则民不服。”

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